CAS broj za neuropeptid Y (svinjski) je 83589-17-7; ima molekulsku formulu C190H287N55O57 i molekulsku težinu od približno 4253,70. Neuropeptid Y (čovek/pacov) ima CAS broj 90880-35-6, molekulsku formulu C189H285N55O57S i molekulsku težinu od približno 4271,68; skladištenje obično zahteva hlađenje na -20 stepeni. NPY posjeduje jedinstvenu konformaciju nalik na ukosnicu poznatu kao nabor "pankreasnog polipeptida".
Neuropeptid Y je široko rasprostranjen kroz centralni nervni sistem; njegova koncentracija je najveća u hipokampusu, a zatim u moždanoj kori, hipotalamusu, talamusu, moždanom deblu i malom mozgu. Arkuatno jezgro hipotalamusa je primarno mjesto sinteze NPY. Specifične populacije neurona koji eksprimiraju NPY- nalaze se u dorzalnom jezgru raphe i ventrolateralnoj periakveduktalnoj sivini moždanog stabla. U perifernom nervnom sistemu, NPY se primarno ko-lokalizira s norepinefrinom u simpatičkim nervima i oslobađa se iz simpatičkih nervnih završetaka. Kardiovaskularni sistem sadrži obilje NPY nervnih vlakana, sa NPY široko rasprostranjenim oko srca i krvnih sudova.
